앞의 잇은 모로코 뒤의 잇은 팀부크를 의미하는 서로 다른 대명사입니다.

문법적으로 상관은 없으나, 저런 경우는 피해서 씁니다.

원래의 분사구문을 Moroco took over Timbuktu, it controlled it until 1780.로 바꾸시면 두개의 it이 각각 무엇을 의미하는지 혼돈이 됩니다. 그래서 굳이 바꾸자면, Moroco took over Timuktu, and the former(전자) controlled the later(후자) until 1780.로 하는게 이해가 분명할 것 같아요.

그리고 분사구문도 원래의 문장보다는 Taking over

모두 감사합니다